[020] イメージング質量顕微鏡

iMScope(島津製作所)〔設置部局：医学系研究科〕

[090] 共焦点レーザースキャン顕微鏡

LSM 710(Carl-Zeiss)〔設置部局：生命科学研究科〕

[096] 3D測定レーザー顕微鏡

オリンパス　LEXT OLS〔設置部局：多元物質科学研究所〕

[100] 多種試料観察用走査電子顕微鏡システム（クロスセクションポリッシング）

IB-09020 CP (クロスセクションポリッシャ)(日本電子)〔設置部局：産学連携先端材料研究開発センター〕

[198] 超解像レーザー顕微鏡

TCS SP8 STED（Leica Microsystems）〔設置部局：医工学研究科〕

[199] 高速高精細多光子・共焦点イメージング対応レーザー顕微鏡システム

A1RMP-MR（ニコン）〔設置部局：医工学研究科〕

[212] 共焦点スペクトルイメージャー 〔リンク〕

Carl Zeiss Microscopy　LSM780 〔設置部局：医学系研究科〕

[227] レーザーマイクロダイセクション(LMD7000)

Leica Microsystems　LMD7000〔設置部局：歯学研究科〕

[264] 高周波振動レーザー観察システム 〔リンク〕

Polytec〔設置部局：工学研究科〕

[268] 走査型プローブ顕微鏡システム

日立ハイテクサイエンス(エスアイアイ･ナノテクノロジー)　　NanoNaviReal〔設置部局：工学研究科〕

[349] TissueFAXS i4 測定ユニット

Tissue Gnostics TG-9101-T〔設置部局：病院〕

[352] TissueFAXS細胞解析ソフトウェアシステム

Tissue Gnostics　TG-2-200/202〔設置部局：病院〕

[396] HSオールインワン蛍光顕微鏡

キーエンス　BZ-9000〔設置部局：病院〕

[419] 共焦点レーザー顕微鏡システム

ニコン　C2si〔設置部局：病院〕

[518] 高分解能共焦点レーザー顕微鏡システム 〔リンク〕

Carl Zeiss Microscopy　LSM800 〔設置部局：医学系研究科〕

[530] 形状解析レーザ顕微鏡

キーエンス　VK-X1100/1000SP2606 〔設置部局：AIMR〕

[582] AFM

日立ハイテクサイエンス nano cute　[設置部局：電気通信研究所]

[583] 段差計

Bruker DEKTAK XT-A　[設置部局：電気通信研究所]

[590] ワイドレンジナノ形状測定システム（Si室）

島津製作所　FT-3500　[設置部局：電気通信研究所]

[604] 原子間力顕微鏡（Veeco）

Bruker　Dimension Icon　[設置部局：電気通信研究所]

[605] レーザー共焦点顕微鏡（Lasertec）

レーザーテック　H1200　[設置部局：電気通信研究所]

[664] 光学顕微鏡 〔リンク〕

ニコン LV150 FMモジュールセット〔設置部局：未来科学技術共同研究センター〕

[665] 実体顕微鏡ティーチングシステム 〔リンク〕

ニコン SMZ1500〔設置部局：未来科学技術共同研究センター〕

[696] X線顕微鏡

Carl Zeiss、Xradia 800 Ultra〔設置部局：多元物質科学研究所〕

[726] デジタルマイクロスコープ

キーエンス VHX600〔設置部局:電気通信研究所〕